حصلت جامعة الزيتونة الأردنية على شهادة الجودة العالمية الخاصة بالمؤسسات التعليمية(ISO21001:2018)، والتي تمنح للمؤسسات التعليمية لمدة ثلاث سنوات، بعد تحقيقها لمعايير المواصفة التي تركز على المخرجات التعليمية للمؤسسة، وجودة التعليم والبحث العلمي، وتحقيق العدالة وتكافؤ الفرص للمدرسين والعاملين فيها.
والزيتونة هي الجامعة الأولى في الأردن التي حصلت على هذه الشهادة بعد تحقيقها جميع متطلبات هذه المواصفة العالمية، بعد أن جددت شهادة ضمان الجودة ISO9001:2015 للمرة الثانية لمدة ثلاث سنوات 2020-2023، والتي حصلت عليها لأول مرة في العام 2017، كأول جامعة أردنية تحصل على هذه الشهادة التي تركز على القيادة وإدارة المخاطر في المؤسسات التعليمية.