تأسست جامعة الزيتونة الأردنية عام 1993، وحصلت على الترخيص والاعتماد العام في 6/9/1993، بموجب قرار مجلس التعليم العالي ذي الرقم (848) في تاريخ 6/9/1993، وهي تسعى منذ تأسيسها لإعداد الطالب إعداداً علمياً وخلقياً، ليكون قادرا بالنهوض بمسؤوليته في خدمة وطنه وأمته.
بدأت جامعة الزيتونة الأردنية مسيرتها المتميزة في موقعها وبنائها، فهي تتميز بموقعها المطل وأبنيتها ذات الطابع الهندسي الجميل، ثم امتد التميز إلى المرافق الأساسية والتجهيزات العلمية. فالجامعة تعتني عناية فائقة بمرافقها الأساسية، ولاسيما مكتبتها العامة التي تعدّ أحد معالم الجامعة الرئيسية والمختبرات العلمية التي تضم أحدث التجهيزات والمعدات العلمية، كما تولي الجامعة اختيار كوادرها الأكاديمية والإدارية اهتماماً خاصاً، وذلك انطلاقاً من فلسفتها التعليمية الرائدة المرتكزة على تقديم التعليم الجامعي المميز إلى الطالب، بما يتوافق مع إمكانياته الشخصية وقدراته الإبداعية.